Soruşturma kapsamında Boğaziçi İmar Müdürlüğü'nden temin edildiği belirtilen evraklar, eylemin maddi delilleri olarak sunulmuştur. Bunlardan ilki, 15.08.2022 tarihli 1 Nolu Yapı Tatil Tutanağı'dır. İddianameye göre bu tutanakta, "İskanlı ana yapının bordum katına 297,00 m² ilave alan, bodrum kata ilave edilen 297,00 m² alanın üst kısmının zemin kat seviyesinde teras olarak yapıldığı, yapının çatısının kaldırılarak 122,66 m²'lik yeni kat ilave edildiği, iskanlı ana yapının tamamında güçlendirme yapıldığı tespit edilmiştir" şeklinde ifadeler yer almaktadır. İkinci belge ise daha sonraki bir tarihte düzenlenmiş olan "2960 Sayılı Yasaya Göre Düzenlenen Arazi Çalışması Tespit Formu"dur. Bu formda, "Söz konusu yerde yapılan mahallen tetkikte 15.08.2022 tarih 1830 sayılı 1 Nolu Yapı Tatil Tutanağı ile tespit edilen aykırılıklardan yeni ilave katın yıkıldığı ancak diğer aykırılıkların giderilmediği anlaşılmıştır" şeklinde bir tespitin yer aldığı belirtilmektedir. Savcılık, bu ikinci belgenin, Yakup Öner'in yıkımın kısmi ve göstermelik olduğuna dair beyanlarını doğruladığını iddia etmektedir.