İddianame, Eylem 106'ya ilişkin suçlamaları desteklemek amacıyla çeşitli delil kategorilerine atıf yapmaktadır. Bu delillerin başında, soruşturma kapsamında alınan tanık ve şüpheli ifadeleri gelmektedir. Özellikle şüpheliler Deniz Dörtyol, Burak Karakuş, İnan Boztaş, Umut Şenol, Eyüp Subaşı, Gökhan Köseoğlu ve Selman Narman gibi isimlerin verdiği ve bir kısmının "itiraf mahiyetinde" olduğu belirtilen beyanlar, savcılık tarafından ihalelerdeki usulsüz kurguyu ve örgüt içi işleyişi detaylandıran kanıtlar olarak sunulmaktadır. Finansal deliller olarak MASAK ve vergi raporlarına işaret edilmektedir. İddiaya göre bu raporlar, alt ihaleleri alan firmalar ile örgüt üyeleri arasındaki para transferlerini, sahte fatura akışını ve haksız kazancın "SİSTEM"e nasıl aktarıldığını göstermektedir. Teknik deliller arasında ise HTS (Historical Traffic Search) ve baz istasyonu verileri bulunmaktadır. Savcılık, bu verilerin, şüphelilerin ihale süreçlerinde birbirleriyle olan yoğun iletişimini ve kilit anlardaki buluşmalarını teyit ettiğini iddia etmektedir. Kolluk araştırma tutanakları ise şüphelilerin ifadelerinde geçen adreslerde, şirketlerde ve kişiler hakkında yapılan fiziki ve kaydi araştırmaları içermekte ve iddiaları somutlaştırmak için kullanılmaktadır. Savcılık, tüm bu delillerin bir araya geldiğinde, eylemin münferit bir usulsüzlük olmayıp, organize bir suç faaliyetinin parçası olduğunu gösterdiğini savunmaktadır.