İddianameye göre, soruşturmanın önemli bir delil grubunu, şüphelilerin ve tanıkların verdiği itiraf niteliğindeki ifadeler oluşturmaktadır. Bu ifadelerin, Sayıştay ve bilirkişi raporlarındaki teknik tespitleri doğruladığı ve eylemin arkasındaki amacı ve organizasyonu ortaya koyduğu iddia edilmektedir. Kültür A.Ş. Genel Müdürü şüpheli Murat Abbas'ın ifadesine göre, proje bizzat Murat Ongun tarafından başlatılmış ve kendisi süreçlerin dışında tutulmuştur. Abbas, usulsüzlükler nedeniyle istifa etmek istediğini ancak ikna edildiğini, reklam ve ihale işlerinin yardımcısı Doğan Hamit Doğruer üzerinden Ongun tarafından yürütüldüğünü iddia etmiştir. Abbas, Sayıştay denetimi başlayınca Murat Ongun ve Ertan Yıldız tarafından kendisine, Tuce firmasından seçim çalışmaları için 10 milyon TL, Zeytinburnu adayı için 2 milyon TL gibi paralar alındığının söylendiğini ve Sayıştay'a her şeyi inkar etmesi yönünde talimat verildiğini beyan etmiştir. Yüklenici TUCE firmasının sahibi şüpheli Cem Çelik'in ifadesine göre, kendisi özel sektör işi gibi sunulan projeye çekilmiş, sözleşme dışı inşaat işleri yapmaya zorlanmış ve gelir paylaşım oranı sonradan düşürülmüştür. Çelik, en çarpıcı iddiasında, Barış Kılıç'ın tehdidiyle, yapılmayan reklam işleri için Güldem Şık'ın organize ettiği firmalara 12 milyon TL ödemek zorunda kaldığını, bu paranın kendisinden şantajla alındığını ve dolandırıldığını söylemiştir. Ayrıca elinde para alışverişlerine dair ses ve video kayıtları olduğunu söyleyerek tehdit edildiğini de belirtmiştir. Etkin Pişmanlık hükümlerinden yararlanmak isteyen şüpheli Ertan Yıldız'ın ifadesinde, Dijital Deneyim Müzesi işinin Murat Ongun tarafından organize edildiği, işin bedelinin şişirilmiş faturalarla artırılarak ciddi bir kamu zararı yaratıldığı ve oluşan farkın bir kısmının elden alındığını duyduğunu söylediği aktarılmıştır. Kültür A.Ş. ihale şefi Abdullah Uçan ise ifadesinde, yapım işi ihalesinin istisna kapsamında yapılması için Genel Müdür Yardımcısı Onur Aldı'dan aşırı baskı ve mobbing gördüklerini, direnmelerine rağmen evraklara imza atmak zorunda kaldıklarını iddia etmiştir. Diğer şüpheli ve tanık ifadelerinde de (Vedat Şahin, Kabil Taşçı, Serdar Haydanlı vb.) Murat Ongun'un tüm süreci yönettiği, Emrah Bağdatlı, Güldem Şık ve Kahraman Yeşilyurt gibi kişilerin para trafiğinde ve organizasyonda kilit roller oynadığı yönünde benzer iddialar yer almaktadır.