İddianameye göre, şüpheli Mehmet Faruk Baştürk, 2020 yılında satın aldığı Sarıyer Tarabya'daki Central Hotel'e (yeni adıyla MFB Tarabya Otel) ilişkin imar sorunları yaşamıştır. Boğaziçi İmar Müdürlüğü tarafından yapılan tespitler neticesinde, imara aykırı yapılaşma nedeniyle 27 Ekim 2022'de yapı tatil tutanağı düzenlenmiş, 7 Aralık 2022'de ise 17.434.033,84 TL para cezası kesilmesi ve yapının yıktırılması yönünde encümen kararları alınmıştır. İddiaya göre, bu baskılardan kurtulmak isteyen Baştürk, 15 Ocak 2021'de Malatya'da bir ziyaret sırasında dönemin İBB Başkanı Ekrem İmamoğlu ile görüşerek destek talep etmiştir. Savcılık iddiasına göre, bu görüşmenin ardından Ekrem İmamoğlu, örgütün Boğaziçi'ndeki işlerini yürüten Yakup Öner'i devreye sokmuştur. Baştürk'ün önce Boğaziçi İmar Müdürü Elçin Karaoğlu tarafından Yakup Öner'e yönlendirildiği belirtilmektedir. Etkin pişmanlık hükümlerinden faydalanan Yakup Öner'in ifadesine göre, İmamoğlu'nun talimatıyla Baştürk ile görüşmüş ve otelin sorunlarının çözülmesi karşılığında Malatya'ya bir 'hizmet' (okul, kreş vb.) yapmasını talep etmiştir. Baştürk'ün bu kadar bütçesi olmadığını belirterek 13 milyon TL teklif etmesi üzerine, Öner'in konuyu İmamoğlu'na ilettiği, İmamoğlu'nun ise durumu örgüt yöneticisi Fatih Keleş'e aktarmasını istediği iddia edilmektedir. İddianameye göre, rüşvet anlaşmasının organizasyonu Fatih Keleş'e geçmiştir. Keleş'in, yine etkin pişmanlıktan yararlanan Süleyman Atik'i görevlendirdiği öne sürülmektedir. Süleyman Atik'in ifadesine göre, Fatih Keleş kendisinden Baştürk ile irtibat kurarak yaklaşık 250 bin dolar civarı bir para almasını istemiş, bu rakamın düşük olmasının nedenini ise İmamoğlu'nun Malatya'daki görüşme sonrası 'yardımcı olun' demesi olarak açıklamıştır. Mehmet Faruk Baştürk ifadesinde, Yakup Öner'in kendisini Süleyman Atik'e yönlendirdiğini ve 13 milyon TL'yi iki taksitte ödemek zorunda kaldığını beyan etmiştir. İddiaya göre ödemeler, 2022-2023 yılları içinde, bir kısmı Tarabya'da Carrefour önünde, diğer kısmı ise Çobançeşme'de bir kafede, Süleyman Atik tarafından gönderilen kuryelere nakit olarak yapılmıştır. Soruşturma kapsamında, şüpheli Mehmet Faruk Baştürk'e ait Berat Un ve Yem Fabrikası Nakliyat Gıda Pazarlama İthalat ve İhracat San. ve Tic. Ltd. Şti. adına kayıtlı, İstanbul ili, Sarıyer ilçesi, Tarabya Mahallesi, 1030 ada, 2 parselde bulunan otel ve imar durumu incelenmiştir. Boğaziçi İmar Müdürlüğü'nden temin edilen 27.10.2022 tarihli Yapı Tatil Tutanağı, 07.12.2022 tarihli 17.434.033,84 TL'lik para cezası ve yıkım kararlarını içeren Encümen Kararları ve 02.05.2025 tarihli Yıkım Tespit Tutanağı dosyaya eklenmiştir. HTS-Baz analizlerinde, 15.01.2021'de Ekrem İmamoğlu ve Mehmet Faruk Baştürk'ün Malatya'da aynı yerden baz verdikleri, ayrıca Yakup Öner, Süleyman Atik, Elçin Karaoğlu ve Mehmet Faruk Baştürk arasında çeşitli tarihlerde irtibat ve ortak baz kayıtları bulunduğu tespit edilmiştir. İddianamede, şüpheli Mehmet Faruk Baştürk'ün, imara aykırı yapılarına ilişkin cezalardan ve yıkım kararından kurtulmak amacıyla rüşvet verdiği; şüpheli Ekrem İmamoğlu'nun ise örgüt lideri olarak rüşvet alınması talimatını vererek, şüpheli Fatih Keleş'in de örgüt yöneticisi olarak bu talimatı uygulayarak rüşvet alma suçunu işledikleri iddia edilmektedir. Şüpheliler Elçin Karaoğlu, Yakup Öner ve Süleyman Atik'in ise bu rüşvete aracılık ettikleri öne sürülmektedir. Savcılık, bu eylemin delilleri olarak şüpheliler Yakup Öner ve Süleyman Atik'in etkin pişmanlık kapsamındaki ifadelerini, şüpheli Mehmet Faruk Baştürk'ün ifadesini, HTS-Baz analiz verilerini, Boğaziçi İmar Müdürlüğü'nden temin edilen resmi evrakları ve kapalı kaynak çalışmalarını göstermiştir. Bu eylem kapsamında şüphelilerin cezalandırılması talep edilmiştir. Ekrem İmamoğlu ve Fatih Keleş'in TCK 252/2 (Rüşvet Alma) maddesinden; Elçin Karaoğlu, Yakup Öner ve Süleyman Atik'in TCK 252/5 delaletiyle 252/2 (Rüşvete Aracılık Etme) maddesinden; Mehmet Faruk Baştürk'ün ise TCK 252/1 (Rüşvet Verme) maddesinden cezalandırılması istenmiştir. Ancak, şüpheliler Yakup Öner ve Süleyman Atik'in etkin pişmanlık hükümlerinden faydalanarak verdikleri ifadelerle örgütün çözülmesine yardımcı oldukları gerekçesiyle haklarında TCK 254/3 maddesinin uygulanması talep edilmiştir.