İddianameye göre, Ekrem İmamoğlu liderliğindeki suç örgütü, Kirazlı-Halkalı metro hattı yapım işiyle ilgili iki ayrı pazarlık usulü ihaleye fesat karıştırmıştır. Savcılığın iddiasına göre, ilk ihale (2024/1243475), önceden anlaşılan Yapı Merkezi firmasına verilmek üzere kurgulanmış, ancak firmanın kesinleşmiş SGK borcu gibi yasal engelleri nedeniyle sözleşme imzalayamayacağının anlaşılması üzerine, 697.000.000,00 TL'lik kamu zararına yol açacak şekilde usulsüzce iptal edilmiştir. İkinci ihalede de (2024/1524796) benzer usulsüzlüklerin devam ettiği öne sürülmektedir. İddianameye göre tüm bu süreç, örgüt yöneticisi olduğu iddia edilen Fatih Keleş'in Yapı Merkezi yetkilileriyle yaptığı %7-10'luk bir rüşvet anlaşması çerçevesinde yürütülmüştür. İddianamede eyleme katıldığı iddia edilen şüpheliler ve rolleri şu şekilde sıralanmaktadır: Örgüt lideri olduğu iddia edilen Ekrem İmamoğlu'nun talimatları verdiği, örgüt yöneticisi olduğu iddia edilen Fatih Keleş'in ise rüşvet anlaşmasını bizzat yürüttüğü öne sürülmektedir. İBB görevlilerinden Ahmet Önal (Avrupa Yakası Raylı Sistemler Şube Müdürü, Komisyon Başkanı), Ceyhun Avşar (Raylı Sistemler Daire Başkanı, İhale Yetkilisi), Abdulbaki Yayla (Muhasip Üye), Osman Şahin (Uzman Üye), Hakan Kuk (Uzman Üye), Burak Salman (Uzman Üye), Sezen Algedik (Yedek Üye) ve Akif Gündüz'ün (Uzman Üye) ihale komisyonlarında görev alarak usulsüzlüklere göz yumdukları iddia edilmektedir. Firma yetkililerinden ise Yapı Merkezi firmasından Mustafa Başar Arıoğlu, Sami Özge Arıoğlu, Erdem Arıoğlu, Köksal Anadol, Emre Aykar ve Mustafa Erkan Saatçı; AKM Yapı firmasından Mehmet Karataş, Can Karataş ve Erdinç Karataş; KCT Yol Yapı firmasından ise Cengiz Tosun'un suça iştirak ettikleri iddia edilmektedir. Savcılığın iddiasına göre suçun işleniş biçimi şu şekildedir: İlk olarak, şüpheli Fatih Keleş'in, Yapı Merkezi yetkilileri Mustafa Başar Arıoğlu ve Sami Özge Arıoğlu'nu Haliç'teki bir tesise davet ederek, ihale bedeli üzerinden %7-10 komisyon ve Adem Soytekin'in firmasına alt yüklenicilik verilmesi konusunda rüşvet anlaşması yaptığı iddia edilmektedir. Ardından, 2024/1243475 numaralı ilk ihalenin, yaklaşık maliyetin önceden sızdırılması ve SGK borcu olan Yapı Merkezi gibi yeterliliği olmayan firmaların katılımının sağlanmasıyla kurgulandığı öne sürülmektedir. İhalenin Yapı Merkezi ortaklığına verilmesinden sonra, firmanın SGK borcu nedeniyle sözleşme imzalayamayacağı anlaşılınca, 697 Milyon TL'lik geçici teminatın hazineye irat kaydedilmesini önlemek amacıyla, "yeterli rekabet oluşmadığı" bahanesiyle ihalenin usulsüzce iptal edildiği iddia edilmektedir. Daha sonra düzenlenen 2024/1524796 numaralı ikinci ihalede de Yapı Merkezi'nin, gerekli teminatı sunmamasına rağmen usulsüz katılımına göz yumulduğu iddia edilmektedir. İddianamede yer alan somut verilere göre, 2024/1243475 İKN'li ilk ihale 26.09.2024 tarihinde yapılmış, yaklaşık maliyeti 22.574.198.287,72 TL olarak belirlenmiş ve 22.469.000.300,00 TL bedelle Yapı Merkezi-AKM Yapı-KCT Yol Yapı iş ortaklığına verilmiştir. Bu ihalenin 07.10.2024'te iptal edilmesiyle 697.000.000,00 TL kamu zararı oluştuğu iddia edilmektedir. İkinci ihale olan 2024/1524796 İKN'li ihalenin ise 08.11.2024'te yapıldığı ve yaklaşık maliyetinin 22.863.766.041,14 TL olduğu belirtilmektedir. İddialar, Fatih Keleş ile Mustafa Başar Arıoğlu arasında 07.05.2024, 23.08.2024, 11.10.2024 tarihlerinde; Mehmet Karataş ile Mustafa Başar Arıoğlu arasında 04.09.2024, 07.09.2024, 16.09.2024, 26.09.2024 tarihlerinde ve Adem Soytekin ile Arıoğlu kardeşler arasında Eylül-Ekim 2024'te gerçekleştiği iddia edilen HTS-Baz kayıtlarına dayandırılmaktadır. Ayrıca Yapı Merkezi'nin 20.09.2024'te SGK borcunu taksitlendirme talebinde bulunduğu bilgisi de dosyada yer almaktadır. Savcılık tarafından iddia edilen kamu zararı, 2024/1243475 numaralı ihalenin usulsüz iptali sonucu, ihaleyi kazanan ancak sözleşme imzalama yeterliliği bulunmayan Yapı Merkezi ortaklığının yatırdığı 697.000.000,00 TL tutarındaki geçici teminatın, kanun gereği hazineye gelir kaydedilmesi gerekirken firmaya iade edilmesiyle oluşmuştur. Soruşturma kapsamında savcılık, iddialarını şüpheliler Mustafa Başar Arıoğlu, Sami Özge Arıoğlu ve Mehmet Karataş'ın ikrar niteliğindeki beyanlarına; örgüt yöneticileri/üyeleri olduğu iddia edilen Adem Soytekin, Ertan Yıldız ve Yakup Öner'in ifadelerine; bilirkişi İbrahim Süren tarafından hazırlanan 15.04.2025, 02.05.2025 ve 25.09.2025 tarihli raporlara; şüpheliler Ahmet Önal ve Ceyhun Avşar arasında geçtiği iddia edilen "yüzde 10 alacağız" şeklindeki mesajlaşma kayıtlarına; HTS-Baz analiz çalışmalarına ve ihale dosyaları ile SGK yazışmaları gibi resmi belgelere dayandırmaktadır. İddianame sonucunda şüphelilerin Rüşvet Anlaşması (TCK 252/1-3) ve İhaleye Fesat Karıştırma (TCK 235/2.a-2, b) suçlarından cezalandırılmaları talep edilmektedir. Örgüt lideri olduğu iddia edilen Ekrem İmamoğlu ve örgüt yöneticisi olduğu iddia edilen Fatih Keleş'in eylemlerinin ise ayrıca Suç Örgütü Kurma ve Yönetme (TCK 220/1-4-5) suçu kapsamında değerlendirilmesi istenmektedir.