İddianameye göre, İMAMOĞLU suç örgütü olarak nitelendirilen yapı, gelir elde etmek amacıyla İBB iştiraki Ağaç A.Ş.'yi bir araç olarak kullanmıştır. Bu kapsamda, Ağaç A.Ş. ile iş yapan DY Grup ve Menkulsa İnşaat firmalarının yetkilileri olan şüpheliler Dinçer Kantar, Yücel Mengir ve Ali İhsan Mengir'den, aldıkları ihaleler ve birikmiş alacaklarının ödenmesi karşılığında sistematik olarak rüşvet talep edildiği ve alındığı iddia edilmektedir. Savcılığa göre, bu rüşvetler nakit, hediye kartı ve ciro edilmiş çek gibi çeşitli yöntemlerle toplanmış ve örgütün "SİSTEM" olarak adlandırılan yapısına aktarılmıştır. İddianameye göre eylemin merkezinde, örgüt lideri olduğu iddia edilen Ekrem İmamoğlu bulunmaktadır. Rüşvet taleplerinin, örgüt yöneticisi olduğu iddia edilen Ertan Yıldız'ın talimatıyla, Ağaç A.Ş. Genel Müdürü Ali Sukas ve Satın Alma Müdürü Ümit Polat tarafından gerçekleştirildiği öne sürülmektedir. Şüpheliler Dinçer Kantar, Yücel Mengir ve Ali İhsan Mengir rüşvet veren konumundadır. Şüpheli Hüsnü Yüksel Tunar'ın paraların toplandığı "kasa" rolünü üstlendiği, şüpheli Murat Or'un (Ali Sukas'ın özel kalemi) ve Fatih Yağcı'nın (Ağaç A.Ş. satın alma şefi) ise rüşvet paralarının teslim alınmasında aracılık ettikleri iddia edilmektedir. Örgüt yöneticisi olduğu iddia edilen Fatih Keleş'in de eyleme iştirak ettiği belirtilmektedir. İddiaya göre rüşvet mekanizması birden fazla yöntemle işlemiştir. İlk olarak, şüpheli Ümit Polat'ın, firma yetkililerini tehdit ederek (iş ve ödeme alamama) Boyner hediye kartları ve nakit para (USD) talep ettiği öne sürülmektedir. İkinci olarak, 2024 yerel seçimleri için "seçim yardımı" adı altında para istendiği ve bu paranın şüpheli Murat Or veya Fatih Yağcı'ya teslim edilmesinin talimatlandırıldığı iddia edilmektedir. Üçüncü ve en büyük meblağlı yöntemde ise, bir ithal torf alımı ihalesinde, şüphelilerin verdiği 2.600 TL/m3'lük teklifin, aradaki farkın rüşvet olarak ödenmesi koşuluyla 2.930 TL/m3'e revize ettirildiği, bu fark olan yaklaşık 6.000.000 TL'nin (183.760 USD) şüpheli Hüsnü Yüksel Tunar'a teslim ettirildiği iddia edilmektedir. Son olarak, yapılan işler karşılığında yine Ertan Yıldız adına 5.000.000 TL "bağış" istendiği, bu paranın 2.500.000 TL'lik kısmının Ağaç A.Ş.'nin verdiği bir çekin Hüsnü Yüksel Tunar'a ciro edilmesiyle, kalanının ise nakit olarak yine Tunar'a teslim edilmesiyle ödendiği iddia edilmektedir. İddianamede yer alan ve şüphelilerin ikrarına dayandırılan bilgilere göre, rüşvet eylemleri Aralık 2023 ile Mart 2025 arasında gerçekleşmiştir. Bu süreçte; 22.12.2023'te 100.000 TL'lik Boyner kartı, 20.01.2024'te 10.000 USD nakit, 12.03.2024'te seçim yardımı olarak 300.000 TL, 14.06.2024'te ithal torf ihalesi farkı olarak 6.000.000 TL (183.760 USD), 22.07.2024'te 2.000 USD nakit, 12.12.2024'te 200.000 TL'lik Boyner kartı, 2024 sonu-2025 başında ise 2.500.000 TL değerindeki 20.02.2025 keşide tarihli 0145293 seri numaralı Kuveyttürk çeki ve 2.500.000 TL nakit olmak üzere toplamda 12.229.350,00 TL rüşvet verildiği iddia edilmektedir. Rüşvet veren firmalar DY Grup ve Menkulsa İnşaat'tır. Savcılık, bu eylemlerin kamuya ait bir iştirak olan Ağaç A.Ş. üzerinden gerçekleştirildiğini, ihalelerde usulsüzlük yapılarak ve rüşvet alınarak kamunun zarara uğratıldığını ve elde edilen haksız gelirin İMAMOĞLU suç örgütü olarak adlandırılan yapının finansmanında kullanıldığını iddia etmektedir. Savcılık iddialarını, rüşveti verdiklerini belirten şüpheliler Dinçer Kantar, Yücel Mengir ve Ali İhsan Mengir'in etkin pişmanlık hükümleri kapsamında verdikleri detaylı ve ikrar niteliğindeki ifadelere dayandırmaktadır. Bu ifadelerin; MASAK raporları, HTS ve baz istasyonu analizleri, şüpheliler arası para transferlerini gösteren banka dekontları, Boyner mağazasından alınan hediye kartlarına ilişkin cevabi yazı, rüşvet olarak ciro edildiği iddia edilen 0145293 seri numaralı çek ve banka kayıtları, diğer şüpheli ve gizli tanık (Gürgen) beyanları gibi delillerle desteklendiği öne sürülmektedir. Şüpheliler Yücel Mengir, Ali İhsan Mengir ve Dinçer Kantar hakkında TCK 252/1 (Rüşvet Verme) ve 43/1 (Zincirleme Suç) maddelerinden işlem yapılması, ancak TCK 254/2 (Etkin Pişmanlık) uyarınca ceza verilmemesi talep edilmektedir. Şüpheliler Ali Sukas, Hüsnü Yüksel Tunar ve Ümit Polat hakkında TCK 252/2 (Rüşvet Alma) ve 43/1 (Zincirleme Suç) maddelerinden; şüpheliler Murat Or ve Fatih Yağcı hakkında TCK 252/2-5 (Rüşvet Suçuna Aracılık Etme) maddesinden; örgüt lideri olduğu iddia edilen Ekrem İmamoğlu ile örgüt yöneticileri olduğu iddia edilen Ertan Yıldız ve Fatih Keleş hakkında ise TCK 220/1-4-5 (Suç Örgütü) delaletiyle TCK 252/2 (Rüşvet Alma) ve 43/1 (Zincirleme Suç) maddelerinden cezalandırılmaları talep edilmektedir.